Al in de 14e eeuw stond er een kapelletje op het ‘Sint Aagtenbergje’, een stukje grond aan de Veurse Achterweg, dat iets hoger gelegen was dan de omgeving.
Het was toegewijd aan de heilige Agatha, maagd en martelares.

De kapel die er toen stond, is helaas in de 80-jarige oorlog vernietigd door de Spanjaarden. Pas in 1795 werd het officieel als begraafplaats ingericht.

In 1832 is het Katholieke kerkbestuur in bezit gekomen van het stukje grond.
De begraafplaats werd echter tot 1845 beheerd door de gemeente Veur.
Kort hierna is er weer een kapelletje op gebouwd. De kapel die er nu staat, is in 1967 gebouwd en door Pastoor H.L Nederstigt ingewijd.

In 1970 is de toen parochiële begraafplaats gewijzigd in een zelfstandige rechtspersoon. Het bestuur wordt samengesteld uit leden die betrokken zijn bij het Leidschendamse parochieleven.

Meer historische informatie op de website van het Meertens Instituut